Fasilitas merupakan hal yang penting dalam mendukung transfer ilmu pengetahuan di kampus. Fasilitas yang saat ini dikelola oleh Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan USNI diantaranya adalah:
*Beberapa fasilitas pendukung lainnya masih terus diusahakan pembangunannya saat ini yakni Stasiun Lapang Kelautan yang rencananya berlokasi di Ujung Genteng, Jawa Barat.